Fakultní nemocnici Brno tvoří tři pracoviště, která se nacházejí v různých částech města Brna:
- Pracoviště medicíny dospělého věku, které se nachází v Brně-Bohunicích, poskytuje základní, specializovanou i superspecializovanou léčebnou, ošetřovatelskou a diagnostickou ambulantní i lůžkovou péči dospělým pacientům ve všech základních oborech. Kromě poskytování zdravotní péče je areál nemocnice hlavní výukovou základnou Lékařské fakulty Masarykovy univerzity, která se nachází v její těsné blízkosti, a současně jedním z nejvýznamnějších vědeckých pracovišť v oblasti léčebných a diagnostických metod v České republice.
- Pracoviště dětské medicíny (Dětská nemocnice), které se nachází v Brně – Černých Polích, je specializované a komplexní pracoviště pro dětské pacienty od narození do 19 let. V rámci Dětské nemocnice existuje několik specializovaných center, která patří mezi přední evropská pracoviště svého druhu. Dětská nemocnice je pediatricko-onkologickým centrem pro Moravu a Slezsko, od roku 2000 zde působí jedno ze dvou vysoce specializovaných dětských traumacenter v České republice.
- Pracoviště reprodukční medicíny (Porodnice), které se nachází v centru Brna, je jedním ze dvou pracovišť Gynekologicko-porodnické kliniky Lékařské fakulty Masarykovy univerzity. Zajišťuje komplexní péči porodnickou, gynekologickou, onkogynekologickou a vysoce specializovanou komplexní péči v oblasti perinatální medicíny a asistované reprodukce. Koncem 70. let byl v porodnici zahájen úspěšný program mimotělního oplodnění a metoda fertilizace in vitro byla od r. 1986 zavedena do klinické praxe. V současnosti nabízí IVF centrum všechny dosud známé metody a techniky umělého oplodnění.